docs: restructuration complète du README en rapport unifié

- Transformation du README en rapport professionnel unifié
- Structure cohérente : Introduction → Partie 1 → Partie 2 → Conclusions → Annexes
- Intégration fluide des deux parties comme continuum scientifique
- Déplacement des détails techniques (outils, compilation) en annexes
- Enrichissement des analyses et interprétations
- Ajout de références scientifiques complètes
- Total: 1105 lignes de documentation professionnelle